[R] Managing NA values in aggregate

Jeff Newmiller jdnewm|| @end|ng |rom dcn@d@v|@@c@@u@
Sat Sep 4 18:21:38 CEST 2021

Literal translation...

aggregate( mydf$value
         , mydf[ , "year_month", drop=FALSE ]
         , function( x ) if ( all( is.na( x ) ) ) NA else sum( x, na.rm = TRUE )

On September 4, 2021 9:06:57 AM PDT, Stefano Sofia <stefano.sofia using regione.marche.it> wrote:
>Dear R-list users,
>I encountered a silly problem using aggregate, but I am not able to get rid of it.
>I read the manual quite carefully, probaby not enough.
>Suppose I have the following data frame:
>mydf <- data.frame(year_month=rep(c("2003-12", "2004-12", "2005-12"), 3), station_number=c(rep(1818,3), rep(1819,3), rep(1820,3)), value=c(NA, NA, 20, NA, NA, 40, NA, 15, 50))
>I want aggregate the column value by the column year_month, but I need to preserve rows with NA when all data are NA:
>aggregate(mydf$value, list(mydf$year_month), sum) gives
>1 2003-12  NA
>2 2004-12  NA
>3 2005-12 110
>aggregate(mydf$value, list(mydf$year_month), sum, na.rm=TRUE) gives
>1 2003-12   0
>2 2004-12  15
>3 2005-12 110
>but I need
>1 2003-12   NA
>2 2004-12  15
>3 2005-12 110
>How can I get it?
>Thank you for your attention and your help
>         (oo)
>--oOO--( )--OOo--------------------------------------
>Stefano Sofia PhD
>Civil Protection - Marche Region - Italy
>Meteo Section
>Snow Section
>Via del Colle Ameno 5
>60126 Torrette di Ancona, Ancona (AN)
>Uff: +39 071 806 7743
>E-mail: stefano.sofia using regione.marche.it
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>Questo messaggio  stato analizzato da Libraesva ESG ed  risultato non infetto.
>This message was scanned by Libraesva ESG and is believed to be clean.
>	[[alternative HTML version deleted]]
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>and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.

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