[R] Managing NA values in aggregate

[Stefano Sofia]

Dear R-list users,
I encountered a silly problem using aggregate, but I am not able to get rid of it.
I read the manual quite carefully, probaby not enough.
Suppose I have the following data frame:

mydf <- data.frame(year_month=rep(c("2003-12", "2004-12", "2005-12"), 3), station_number=c(rep(1818,3), rep(1819,3), rep(1820,3)), value=c(NA, NA, 20, NA, NA, 40, NA, 15, 50))

I want aggregate the column value by the column year_month, but I need to preserve rows with NA when all data are NA:

aggregate(mydf$value, list(mydf$year_month), sum) gives
1 2003-12  NA
2 2004-12  NA
3 2005-12 110

aggregate(mydf$value, list(mydf$year_month), sum, na.rm=TRUE) gives
1 2003-12   0
2 2004-12  15
3 2005-12 110

but I need
1 2003-12   NA
2 2004-12  15
3 2005-12 110

How can I get it?
Thank you for your attention and your help
Stefano


         (oo)
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Stefano Sofia PhD
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Meteo Section
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