[R-es] ¿Cómo puedo determinar cuellos de botella con información genética de poblaciones remanentes en R?

[Lucas Fernandez Seivane]

Se me olvidó este https://academic.oup.com/mbe/article/31/7/1929/2925788

ᐧ

2018-06-07 23:48 GMT+02:00 Lucas Fernandez Seivane <quevedin using gmail.com>:

> Hola a todos
> No es mi campo, pero estos dos paquetes pueden ser de utilidad
> https://grunwaldlab.github.io/Population_Genetics_in_R/Introduction.html
> https://cran.r-project.org/web/packages/PopGenKit/PopGenKit.pdf
> Saludos
> ᐧ
>
> 2018-06-07 23:30 GMT+02:00 eric <ericconchamunoz using gmail.com>:
>
>> Hola Diego, no se la respuesta a tu pregunta especifica, pero si se que
>> hay una linea de desarrollo en R para tratar con muchos tipos de datos del
>> area biologica, como datos de citometria, QPCR y esas cosas. Se llama
>> BIOCONDUCTOR, su web es www.bioconductor.org. De su pagina saco lo
>> siguiente:
>>
>> Bioconductor provides tools for the analysis and comprehension of
>> high-throughput genomic data. Bioconductor uses the R statistical
>> programming language, and is open source and open development. It has two
>> releases each year, 1560 software packages
>> <https://www.bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Software>,
>> and an active user community. Bioconductor is also available as an AMI
>> <https://www.bioconductor.org/help/bioconductor-cloud-ami/> (Amazon
>> Machine Image) and a series of Docker
>> <https://www.bioconductor.org/help/docker/> images.
>>
>> Pienso que ese proyecto te puede proporcionar herramientas de software
>> para hacer lo que necesitas.
>>
>> Saludos,
>>
>> Eric.
>>
>>
>>
>> On 06/07/2018 05:19 PM, DIEGO PAUL VELEZ MORA wrote:
>>
>> Buen día a todos,
>>
>> Alguien conoce si existe la manera de determinar cuellos de botella pasados o actuales en poblaciones naturales remanentes con información genética (microsatélites) en R. Gracias por su valiosa ayuda de antemano.
>>
>> Saludos,
>> Diego
>>
>> ________________
>> Diego P. Vélez Mora
>> Departamento de Ciencias Biológicas
>> UNIVERSIDAD TÉCNICA PARTICULAR DE LOJA
>> San Cayetano Alto s/n
>> Loja, Ecuador
>> Tel: (593-7) 370 1444
>> Extensión: 3030
>>
>>
>> [UTPL]
>> NOTA DE DESCARGO:
>>
>> “El contenido de este correo electrónico y/o sus anexos son de carácter confidencial y para uso exclusivo de la persona natural o jurídica a quien se dirige. Si usted no es el destinatario de esta transmisión electrónica, por favor, reenvíelo de inmediato al emisor y elimine el correo y sus anexos. Cualquier uso, reproducción, distribución, copia, o cualquier otra acción respecto del mismo deberá realizarse previa autorización de la UTPL. Este correo debe ser utilizado únicamente para fines académicos y/o administrativos de la UTPL, por lo que la universidad no es responsable de las opiniones, criterios o información que consten en este correo y que no esté relacionado con las actividades propias de la institución”.
>>
>>
>> 	[[alternative HTML version deleted]]
>>
>> _______________________________________________
>> R-help-es mailing listR-help-es using r-project.orghttps://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
>>
>> --
>> Nota: Las tildes se han omitido para asegurar compatibilidad con algunos lectores de correo.
>>
>>
>> _______________________________________________
>> R-help-es mailing list
>> R-help-es using r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
>>
>

	[[alternative HTML version deleted]]