[R-pkg-devel] devtools::check() endless loop

[Roland Fuß]

Your package seems to import an `sql` function twice, once from dbplyr and once from dplyr. This looks like you are too generous in your NAMESPACE file. You should use `importFrom` and avoid importing all functions from other package namespaces.

----- Ursprüngliche Mail -----
> Von: "Hüsing, Johannes via R-package-devel" <r-package-devel using r-project.org>
> An: r-package-devel using r-project.org
> Gesendet: Dienstag, 9. Dezember 2025 16:02:10
> Betreff: Re: [R-pkg-devel] devtools::check() endless loop

> Dr. Johannes Hüsing
> Epidemiologie
> 
> 
> Landeskrebsregister NRW gGmbH
> Gesundheitscampus 10
> 44801 Bochum
> T 0234 54509-216
> F 0234 54509-499
> Johannes.Huesing using krebsregister.nrw.de
> www.landeskrebsregister.nrw.de
> 
> Newsletter LKR NRW jetzt anmelden unter Newsletter
> <www.landeskrebsregister.nrw/aktuelles/newsletter>
> Geschäftsführer
> 
> 5. Landesqualitätskonferenz
> Mittwoch 08. Oktober 2025 in Münster
> 20 Jahre Krebsregistrierung für Nordrhein-Westfalen
> Eine Erfolgsgeschichte für die onkologische Forschung und Versorgung
> Anmeldung: https://www.landeskrebsregister.nrw/5-landesqualitaetskonferenz-nrw/
> 
> Dr. Andres Schützendübel
> Vorsitzender der Gesellschafterversammlung
> Staatssekretär Matthias Heidmeier
> Sitz der Gesellschaft
> Bochum
> Registergericht
> Amtsgericht Bochum
> HRB 17715
> 
> HINWEIS: Diese Nachricht ist nur für den Adressaten bestimmt. Es ist nicht
> erlaubt, diese Nachricht zu kopieren oder Dritten zugänglich zu machen. Sollten
> Sie irrtümlich diese Nachricht erhalten haben, bitte ich um Ihre Mitteilung per
> E-Mail oder unter der oben angegebenen Telefonnummer.
> 
> 
> -----Ursprüngliche Nachricht-----
> Von: Duncan Murdoch <murdoch.duncan using gmail.com>
> 
>>The next step is to fix all the errors and warnings (and some of the notes).  If
>>>you need help with interpreting them, post them here.
> 
> 
> So far I managed to whittle it down zo 1 error, 2 warnings, and 3 notes.
> 
> Topics I may welcome some feedback on:
> 
> * R CMD check does not run from the command line (R does), this is not a biggie
> though, as R CMD check seems to be run as part of devtools::check()
> 
> * "Checking for future timestamps" comes to a pause until a clock server is
> found but rejected for a lack of https protocol
> 
> * How do "Writing R Extensions" and R-pkgs.org relate? Seems to me the main
> difference is the reliance of r-pkgs.org on the usethis package. Speaking of
> this, does a usethis:: function exist which runs @examples in isolation from he
> other checks? The editor fails checking for matched brackets and stuff, so the
> example is the main debugging chore as I cannot seem to run examples without
> devtools::checking the rest.
> 
> * On a related note: browser() seems to be unavailable during running examples,
> correct?
> 
> *  As part of debtools::load_all() I get the Warning: replacing previous import
> 'dbplyr::sql' by 'dplyr::sql' when loading 'staduicc'. I did not invoke sql().
> What am I to infer from this message?
> 
> Thank you very much
> 
> Johannes
> ______________________________________________
> R-package-devel using r-project.org mailing list
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-package-devel

-- 
Thünen-Institut für Agrarklimaschutz/
Thünen Institute of Climate-Smart Agriculture

Bundesallee 65
D-38116 Braunschweig, Germany

Tel./Webex: +49 531 25701967

Email: roland.fuss using thuenen.de

Arbeitsgruppe "Emissionsberichterstattung"/
Working group "Emission Inventories"
Email: emissionsinventare using thuenen.de

Das Johann Heinrich von Thünen-Institut, 
Bundesforschungsinstitut für Ländliche Räume, 
Wald und Fischerei – kurz: Thünen-Institut – 
besteht aus 15 Fachinstituten, die über 
sozioökonomische, ökologische und technologische 
Kompetenz verfügen. Das Thünen-Institut betreibt 
Forschung und Politikberatung mit Bezug zu 
ländlichen Räumen, Landwirtschaft, Wald und Fischerei.

The Johann Heinrich von Thünen Institute, 
Federal Research Institute for Rural Areas, 
Forestry and Fisheries – Thünen Institute 
in brief – consists of 15 specialized 
institutes with socioeconomic, ecological 
and technological expertise. The Thünen 
Institute conducts research and policy advice 
related to rural areas, agriculture, forests 
and fisheries.