[R-pkg-devel] devtools::check() endless loop

[Hüsing, Johannes]

Dr. Johannes Hüsing
Epidemiologie


Landeskrebsregister NRW gGmbH
Gesundheitscampus 10
44801 Bochum
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Geschäftsführer

5. Landesqualitätskonferenz
Mittwoch 08. Oktober 2025 in Münster
20 Jahre Krebsregistrierung für Nordrhein-Westfalen
Eine Erfolgsgeschichte für die onkologische Forschung und Versorgung
Anmeldung: https://www.landeskrebsregister.nrw/5-landesqualitaetskonferenz-nrw/

Dr. Andres Schützendübel
Vorsitzender der Gesellschafterversammlung
Staatssekretär Matthias Heidmeier
Sitz der Gesellschaft
Bochum
Registergericht
Amtsgericht Bochum
HRB 17715

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-----Ursprüngliche Nachricht-----
Von: Duncan Murdoch <murdoch.duncan using gmail.com>

>The next step is to fix all the errors and warnings (and some of the notes).  If >you need help with interpreting them, post them here.


So far I managed to whittle it down zo 1 error, 2 warnings, and 3 notes.

Topics I may welcome some feedback on:

* R CMD check does not run from the command line (R does), this is not a biggie though, as R CMD check seems to be run as part of devtools::check()

* "Checking for future timestamps" comes to a pause until a clock server is found but rejected for a lack of https protocol

* How do "Writing R Extensions" and R-pkgs.org relate? Seems to me the main difference is the reliance of r-pkgs.org on the usethis package. Speaking of this, does a usethis:: function exist which runs @examples in isolation from he other checks? The editor fails checking for matched brackets and stuff, so the example is the main debugging chore as I cannot seem to run examples without devtools::checking the rest.

* On a related note: browser() seems to be unavailable during running examples, correct?

*  As part of debtools::load_all() I get the Warning: replacing previous import 'dbplyr::sql' by 'dplyr::sql' when loading 'staduicc'. I did not invoke sql(). What am I to infer from this message?

Thank you very much

Johannes