[R] local maxima positions in a vector with duplicated values

Stefano Sofia @te|@no@@o||@ @end|ng |rom reg|one@m@rche@|t
Mon Mar 29 15:52:39 CEST 2021


Dear Bill, Bert, Greg and Abby,
I tested your code (honestly apart from Abby's solution because it needed an additional package and I run R in a server which is not administrated by myself), they work and I found them equivalent. (Probably Bill's and Greg's solutions are a bit faster than Bert's.)

In my real application I found a case where none of them work: when the series is monotonic. In this case the last number of the vector (or the last duplicated numbers) is not a maximum but it is anyway the highest number of the vector:

>x <- c(1,1,1,2,2,3,4,4,4,5,6,6,6)

The error is: argument is of length zero.
Your code is at the moment too complicated for me to modify. I ask if there is an "easy" extension of the code that you kindly wrote for me to handle also this possibility.

Thank you for everything
Stefano



         (oo)
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Stefano Sofia PhD
Civil Protection - Marche Region - Italy
Meteo Section
Snow Section
Via del Colle Ameno 5
60126 Torrette di Ancona, Ancona (AN)
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E-mail: stefano.sofia using regione.marche.it
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Da: Bill Dunlap [williamwdunlap using gmail.com]
Inviato: venerdì 26 marzo 2021 18.40
A: Stefano Sofia
Cc: r-help mailing list
Oggetto: Re: [R] local maxima positions in a vector with duplicated values

Using rle() may make it easier - finding the peak values is easier and
select from cumsum(lengths) to get the positions of the last values
before the peaks, then add 1.  I have not tested the following very
much.

function(x) {
  rx <- rle(x)
  cumsum(rx$lengths)[c(diff(diff(rx$values)>0) == -1,FALSE,FALSE)]+1
}

-Bill

On Fri, Mar 26, 2021 at 8:36 AM Stefano Sofia
<stefano.sofia using regione.marche.it> wrote:
>
> Dear list users,
> I need to find local maxima and local minima positions in a vector where there might be duplicates; in the particular in case of
> - duplicated local maxima, I should take the position of the first duplicated value;
> - duplicated local minima, I should take the position of the last duplicated value.
>
> Example:
>
> >x <- c(1,0,0,0,2,2,3,4,0,1,1,0,5,5,5,0,1)
> >which(diff(diff(x)>=0)<0)+1
>
> gives me 8 11 15 while I need 8 10 13;
>
> >which(diff(diff(x)>0)>0)+1
>
> gives me 4 6  9 12 16 while I need 4 9 12 16.
>
> Could you please help me in this task? I would be happier not to use additional packages.
>
> Thank you for your precious help
> Stefano
>
>
>          (oo)
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> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.

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