[R] Sum of columns of a data frame equal to NA when all the elements are NA

[Stefano Sofia]

Thank you.
Perfect solution.

Stefano

         (oo)
--oOO--( )--OOo----------------
Stefano Sofia PhD
Area Meteorologica e  Area nivologica - Centro Funzionale
Servizio Protezione Civile - Regione Marche
Via del Colle Ameno 5
60126 Torrette di Ancona, Ancona
Uff: 071 806 7743
E-mail: stefano.sofia at regione.marche.it
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Da: Duncan Murdoch [murdoch.duncan at gmail.com]
Inviato: mercoledì 21 marzo 2018 17.01
A: Stefano Sofia; r-help at r-project.org
Oggetto: Re: [R] Sum of columns of a data frame equal to NA when all the elements are NA

On 21/03/2018 11:44 AM, Stefano Sofia wrote:
> Dear list users,
> let me ask you this trivial question. I worked on that for a long time, by now.
> Suppose to have a data frame with NAs and to sum some columns with rowSums:
>
> df <- data.frame(A = runif(10), B = runif(10), C = rnorm(10))
> df[1, ] <- NA
> rowSums(df[ , which(names(df) %in% c("A","B"))], na.rm=T)
>
> If all the elements of the selected columns are NA, rowSums returns 0 while I need NA.
> Is there an easy and efficient way to use rowSums within a function like
>
> function(x) ifelse(all(is.na(x)), as.numeric(NA), rowSums...)?
>
> or an equivalent function?

Something like

apply(df[,c("A", "B")], 1, function(x) if (all(is.na(x))) NA else sum(x,
na.rm = TRUE))

should do what you want.

Duncan Murdoch

>
> Thank you for your help
> Stefano
>
>
>
>           (oo)
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> Stefano Sofia PhD
> Area Meteorologica e  Area nivologica - Centro Funzionale
> Servizio Protezione Civile - Regione Marche
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> IMPORTANT NOTICE: This e-mail message is intended to be received only by persons entitled to receive the confidential information it may contain. E-mail messages to clients of Regione Marche may contain information that is confidential and legally privileged. Please do not read, copy, forward, or store this message unless you are an intended recipient of it. If you have received this message in error, please forward it to the sender and delete it completely from your computer system.
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> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
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