[R] Sum of columns of a data frame equal to NA when all the elements are NA

Stefano Sofia stefano.sofia at regione.marche.it
Wed Mar 21 16:44:56 CET 2018


Dear list users,
let me ask you this trivial question. I worked on that for a long time, by now.
Suppose to have a data frame with NAs and to sum some columns with rowSums:

df <- data.frame(A = runif(10), B = runif(10), C = rnorm(10))
df[1, ] <- NA
rowSums(df[ , which(names(df) %in% c("A","B"))], na.rm=T)

If all the elements of the selected columns are NA, rowSums returns 0 while I need NA.
Is there an easy and efficient way to use rowSums within a function like

function(x) ifelse(all(is.na(x)), as.numeric(NA), rowSums...)?

or an equivalent function?

Thank you for your help
Stefano



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Stefano Sofia PhD
Area Meteorologica e  Area nivologica - Centro Funzionale
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