[R] read.table - replaces 'T' with 'TRUE'

[Brian Smith]

Hi,

I had a table with 'T's in it. When I try to read the table, it replaces
all the 'T's with TRUE. Is there a way that I can retain the Ts?

thanks!


Sample table (test.txt):

xx1 xx2 0 0 2 2 A A G G A G A A C C G G G G G G A G A A A G A G A A G G A A
A G G G A G A G G G A G A G G G G G A G G G G G A A C C G G A C A G G G A G
G G A C C C A G A G G G G G G G A A A C A G G G G G G G G G A A G G G G T T
G G A A G G G G G G A A G G G G G G G G A G T T A G A G G G A G C G G G G G
G G A G A G A C G G G G A G A G G G G G G G G G G G C C G G G G A A A G A G
A G G G A G A A A G A G G G G G A A A G G G G G G G A A G G G G G G G G G G
G G A G A G G G G G A A G G G G G G G G G G A A G G G G A G G G A A C C G G
C C C G G G A A G G G G G G C C A A G G G G G G A G G G C C G G A A A A G G
A A G G A G G G A A A G A A G G G G C C G G G G A A G G A A A G G G G G G G
G G A A A G G G C C G G G G A A G G G G G G G G A A G G G G G G G G G G A A
G G C C A A A G A A A A A A A G G G G G A C G G G G A A A G A A T T A G A A
T T A A A A G G G G C C A G G G A G G G G G C C A C A G A G A G A G A G A G
C C A G G G A G A G A A A A A G A G A A A G A G A C A C A C C C A G A G G G
G G A G A G C C G G A G A G A G G G G G A G A G A G A G A G A G G G G G A G
A A A G G G G G A G G G G G G G A A A A G G G G A A A C A G G G A G C C A G
A G G G G G A T A G A G A C A A A G C C A G G G G G A G A A G G A G C C G G
A A G G C C C C G G G G T T C C


> r1 <- read.table(paste(exdir,'test.txt',sep=''),na.strings="",fill=T)
> r1

> r1
   V1  V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
V21 V22 V23 V24 V25 V26 V27 V28 V29 V30 V31 V32
1 xx1 xx2  0  0  2  2  A  A  G   G   A   G   A   A   C   C   G   G   G
G   G   G   A   G   A   A   A   G   A   G   A   A
  V33 V34 V35 V36 V37 V38 V39 V40 V41 V42 V43 V44 V45 V46 V47 V48 V49 V50
V51 V52 V53 V54 V55 V56 V57 V58 V59 V60 V61 V62
1   G   G   A   A   A   G   G   G   A   G   A   G   G   G   A   G   A   G
G   G   G   G   A   G   G   G   G   G   A   A
  V63 V64 V65 V66 V67 V68 V69 V70 V71 V72 V73 V74 V75 V76 V77 V78 V79 V80
V81 V82 V83 V84 V85 V86 V87 V88 V89 V90 V91 V92
1   C   C   G   G   A   C   A   G   G   G   A   G   G   G   A   C   C   C
A   G   A   G   G   G   G   G   G   G   A   A
  V93 V94 V95 V96 V97 V98 V99 V100 V101 V102 V103 V104 V105 V106 V107 V108
V109 V110 V111 V112 V113 V114 V115 V116 V117
1   A   C   A   G   G   G   G    G    G    G    G    G    A    A    G
G    G    G TRUE TRUE    G    G    A    A    G
  V118 V119 V120 V121 V122 V123 V124 V125 V126 V127 V128 V129 V130 V131
V132 V133 V134 V135 V136 V137 V138 V139 V140 V141
1    G    G    G    G    G    A    A    G    G    G    G    G    G    G
G    A    G TRUE TRUE

	[[alternative HTML version deleted]]