[R] duplicate data

[Richard Müller]

Hello,

I have a long list of x-, y- and z-data and try to generate a heatmap.
Obviously there are several data with identical x- and y-values. I get
the following error message:

Error in interp.old(x, y, z, xo = xo, yo = yo, ncp = 0, extrap = extrap,  :
  duplicate data points: need to set 'duplicate = ..'

Unfortunately there seems no help screen on "duplicate". I'd prefer to
average the z-values in case there are identical x/y-values. Is that
possible?

If necessary for an answer I'll copy the short script below.

Thanks for helping!
Richard

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 #RM¨u 5.2.2013, r.mueller at oeko-sorpe.de
require(akima) 		# Das Paket akima wird ben¨otigt, um
			# nicht vorhandene Punkte zu interpolieren# und einen sch¨onen
Farbgradienten hinzukriegen
sorpe <- read.csv("bis_130204-korr.csv")
pdf("sorpe.pdf") 	# Es wird nicht auf den Bildschirm gezeichnet,
			# sondern ein PDF-Dokument erstellt.
zr <- range(290,220)	# Hier wird der Bereich f¨ur die z-Werte# festgelegt:

			
plot(ylim = c(7.9, 8), 	# Der Bereich der Achsen wird definiert
xlim = c(51.30, 51.4),
x ~ y, 			# Es soll ein x-y-Diagramm werden
sorpe,
			# Aufruf der x-, y-, z-Tabelle
pch = NA) 		# Die Punkte f¨ur die x-y-Wertepaare sollen unsichtbar sein (’NA’)
sorpe.li <- interp(sorpe$x, sorpe$y, sorpe$z)
			# Hier werden die fehlenden Punkte interpoliert
image(sorpe.li, 	# In das Diagramm wird ein Rasterbild aus den
interpolierten Werten gezeichnet
zlim = zr, 		# Der vorher definierte Wertebereich wird aufgerufen
col = rev(rainbow( 	# Ein in R vordefiniertes Farbmodell wird verwendet
30, start = 0, end = 8/12)),
			# mit 30 Farbabstufungen, die den z-Werten zugeordnet werden.
add = TRUE) 		# Das Bild wird ¨uber das bereits Vorhandene# gezeichnet
contour(sorpe.li, 	# Isohypsen werden eingezeichnet
add = TRUE)
points(sorpe, 		# Die urspr¨unglichen Messpunkte werden
pch = 1) 		# eingezeichnet, und zwar als Kreise





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Richard Müller . Am Spring 9 . D-58802 Balve
http://www.oeko-sorpe.de - http://www.phytoplankton.info -
http://independent.academia.edu/Richard