[R] problem with 'gnls'
Bruno Tona
tona at stat.math.ethz.ch
Wed Dec 18 15:42:12 CET 2002
I'm working with data measured in a tunnel to estimate the
emission factor of heavy & light vehicles.
I tried to use 'gnls' and I get the following Error:
>> Error in "coef<-.corARMA"(*tmp*, value = c(174.267493382104, 173.412740072763 :
>> Coefficient matrix not invertible
Here is my R-code:
data <- d.plabutsch.neu
# calculating the starting coeficients:
r.CO2.rlm <- rlm(EF.CO2 ~ pLKW.total + Sat + Sun + Fz.total,
data = data, method = "MM", na.action =
na.exclude)
START <- coef(r.CO2.rlm); names(START) <- letters[1:5]
# 'gnls':
r.CO2.gnls <- gnls(log(EF.CO2) ~ log(a + b * pLKW.total) + c * Sat +
d * Sun + e * Fz.total,start = START, data = data,
correlation=corARMA(p=p[2],q=0), na.action = na.exclude)
The data d.plabutsch.neu has the following stucture: (Not all columns are NA!)
> str(d.plabutsch.neu)
`data.frame': 806 obs. of 90 variables:
$ Tag : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ b.Std : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ b.Min : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ e.Std : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ e.Min : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ CO.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ CO.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ CO.diff : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NO.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NO.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NO.diff : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NOx.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NOx.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NOx.diff : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NOx.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NOx.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NOx.diff : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ THC.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ THC.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ THC.diff : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ PM10.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ PM10.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ PM10.diff : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ O3.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ CO2.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ CH4.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ NCH4.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ SO2.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Druck.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Feucht.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Temp.tunn : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Luft.fresh : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Luft.waste : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Menge.CO : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Menge.NOx : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Menge.THC : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.NOx : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.THC : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Emission.CO : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Emission.NOx : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Emission.THC : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ PKW.Nord : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ PKW.Sued : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ PKW.total : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ LKW.Nord : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ LKW.Sued : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ LKW.total : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Fz.Nord : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Fz.Sued : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Fz.total : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pPKW.Nord : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pPKW.Sued : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.Nord : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.Sued : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pPKW.total : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.total : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pPKW.N : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pPKW.S : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.N : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.S : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ weekend : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sat : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sun : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ verbot : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO.t1 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.NOx.t1 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.THC.t1 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO2.t1 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO.t2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.NOx.t2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.THC.t2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO2.t2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO.t3 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.NOx.t3 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.THC.t3 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ EF.CO2.t3 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.total.t1: num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sat.t1 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sun.t1 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Fz.total.t1 : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.total.t2: num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sat.t2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sun.t2 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Fz.total.t2 : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ pLKW.total.t3: num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sat.t3 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Sun.t3 : num NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
$ Fz.total.t3 : int NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
I also tried with an AR(3) and an AR(1). The AR(3) gives the same
error like above and the AR(1) gives the error:
>> Error in optim(fn = function(gnlsPars) -logLik(gnlsSt, gnlsPars), par = c(coef(gnlsSt)), :
>> initial value in vmmin is not finite
>> In addition: There were 14 warnings (use warnings() to see them)
Thanks for any help
regards
Bruno Tona
More information about the R-help
mailing list