[R-es] Paquete dismo, cálculo coeficiente de variación

[Xavier-Andoni Tibau Alberdi]

View(funcion), tambien vale para ver variables.

El mar., 19 jun. 2018 15:34, Marcelino de la Cruz Rot <
marcelino.delacruz using urjc.es> escribió:

> Hola Jaume:
>
> Si miras el código de biovars() verás que la variable bio15 (el
> coeficiente de variación de la precipitación) la obtiene sumando
> previamente 1 a "prec":
>
> p[, 15] <- apply(prec + 1, 1, cv)
>
>
> Es decir, en tu caso,
>
>  > cv(prec+1)
> [1] 109.9637
>
> Lo que coincide con lo proporcionado por biovars, mientras que
>
>  > cv(prec)
> [1] 112.5923
>
>   coincide con tu cálculo manual.
>
> En la página web de WorldClim, donde definieron originalmente esta
> variable no he encontrado una explicación de este sumatorio, pero
> tampoco he buscado mucho...Tal vez en alguno de los artículos en los que
> se describe esta base de datos den razón de este sumatorio.
>
> Saludos,
>
> Marcelino
>
>
>
>
>
>
> El 19/06/2018 a las 11:43, Jaume Tormo escribió:
> > Estimados erreros,
> >
> > Estoy intentando entender como calcula el paquete dismo (
> > https://cran.r-project.org/web/packages/dismo/index.html) un
> coeficiente de
> > variación. Os pongo un ejemplo:
> > tmin <- c(10,12,14,16,18,20,22,21,19,17,15,12) # temperatura mínima media
> > mensual de un año
> > tmax <- tmin + 5 # temperatura máxima media mensual de un año
> > prec <- c(0,2,10,30,80,160,80,20,40,60,20,0) #precipitación media mensual
> > de un año
> > biovars(prec, tmin, tmax) #este comando calcula una serie de variables
> > relevantes para la distribución de especies.
> > #El resultado es:
> >          bio1 bio2     bio3     bio4 bio5 bio6 bio7 bio8     bio9 bio10
> > bio11
> > [1,] 18.83333    5 29.41176 384.5501   27   10   17 22.5 13.83333  23.5
> > 13.83333
> >       bio12 bio13 bio14    *bio15* bio16 bio17 bio18 bio19
> > [1,]   502   160     0 *109.9637*   320     2   260     2
> >
> > La que a mi me interesa es bio15 el coeficiente de variación de la
> > precipitación, pero no me da lo que yo esperaba que me diera:
> >
> >> (sd(prec)/mean(prec))*100
> > [1] *112.5923*
> >
> > ¿Hay otra forma de calcular el Coeficiente de variación? Me estoy
> perdiendo
> > algo. En el manual del paquete (
> > https://cran.r-project.org/web/packages/dismo/dismo.pdf), no explica
> como
> > calcula el indice de variación ¿Hay alguna forma de rebuscar en dentro de
> > biovars para saber que está haciendo?
> >
> > Muchas gracias.
> >
> >
>
> --
> Marcelino de la Cruz Rot
> Depto. de Biología y Geología
> Física y Química Inorgánica
> Universidad Rey Juan Carlos
> Móstoles España
>
> _______________________________________________
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>

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