[R-es] Compilar libro con paquete bookdown (PDF)
Juan Abasolo
ju@n@@b@@olo @ending from ehu@eu@
Mie Jul 18 23:39:32 CEST 2018
Muchas gracias, Marcelino.
Parece que tiene sus vueltas esto de aprender. Cuento qué y cómo conseguí,
por si a alguien más le sirve (yo suelo revisar los correos de otros en
búsqueda de soluciones para mí)
Gracias a tu respuesta lo conseguí generar desde la linea de comando.
bookdown::render_book('index.Rmd', output_format="pdf_document")
También Victor me dió una mano basada en prueba y error y en base a su
solución encontré una mía (para compilar desde las opciones de RStudio).
Él cambió el orden en el archivo _output.yml y puso en primer termino la
opción de PDF, dejándola así:
bookdown::pdf_book:
includes:
in_header: preamble.tex
latex_engine: xelatex
citation_package: natbib
keep_tex: yes
bookdown::epub_book: default
bookdown::gitbook:
css: style.css
config:
toc:
before: |
<li><a href="./">A Minimal Book Example</a></li>
after: |
<li><a href="https://github.com/rstudio/bookdown"
target="blank">Published with bookdown</a></li>
edit: https://github.com/rstudio/bookdown-demo/edit/master/%s
download: ["pdf", "epub"]
Eso a él le funcionó... pero a mí me dio por salida un epub.
Lo terminé consiguiendo borrando todas las referencias a los otros
formatos, tanto en el archivo index.Rmd como _output.yml.
Compilé y salio PDF. Y de ahora en más a aprender LaTeX.
Muchas gracias
2018-07-18 14:03 GMT+02:00 Marcelino de la Cruz Rot <
marcelino.delacruz using urjc.es>:
>
> Es muy sencillo. Escribe esto en la consola:
>
> bookdown::render_book('index.Rmd', output_format="pdf_document")
>
>
> Saludos,
>
> Marcelino
>
>
>
> El 18/07/2018 a las 11:43, Juan Abasolo escribió:
>
>> Gracias, Victor. Tampoco es eso. Si saco la linea
>> site: bookdown::bookdown_site
>> Me sigue compilando en HTML, pero sin hacerlo en todos los capítulos si no
>> solamente el del index.Rmd que tengo abierto.
>>
>> No puedo explicar cuanto me sorprende! Supongo que tendré algún puntito de
>> alguna i que falta y al ponerlo me parecerá tontería. Pero ahora todavía
>> es
>> MISTERIO.
>>
>>
>> 2018-07-18 11:03 GMT+02:00 Víctor Granda García <
>> victorgrandagarcia using gmail.com>:
>>
>> Hola Juan,
>>>
>>> Elimina la linea que comienza con site en el encabezado YAML. Es probable
>>> que ese sea el problema, aunque no estoy seguro del todo.
>>>
>>> Espero que te sirva, un saludo!
>>>
>>> El mié., 18 jul. 2018 10:51, Juan Abasolo <juan.abasolo using ehu.eus>
>>> escribió:
>>>
>>> Gracias, Javier, por la paciencia.
>>>>
>>>> Soy malo explicándome. Ese ejemplo que me das, que es el que da Yihui
>>>> Xie,
>>>> es el que no consigo compilar si no es a GitBook (que es HTML).
>>>>
>>>> El mismo Yihui propone en el libro al que nos referimos los dos y el
>>>> ejemplo en cuestión (referido en el apartado Get Started) modificar el
>>>> código YAML para compilar en PDF.
>>>>
>>>> Efectifvamente, lo que quiero es conseguir que ese ejemplo mínimo me
>>>> funcione, para sustituir sus datos con los míos (que es mi camino
>>>> principal
>>>> de aprendizaje).
>>>>
>>>>
>>>>
>>>> 2018-07-18 0:02 GMT+02:00 Javier Marcuzzi <javier.ruben.marcuzzi using gmail.
>>>> com>:
>>>>
>>>> Estimado Juan Abasolo
>>>>>
>>>>> Yo aprendí algunas cosas ejecutando ejemplos de otros, se me ocurre que
>>>>> intente con el siguiente ejemplo solo para ver si en su computadora se
>>>>> genera el pdf, si de casualidad funciona tendrá un ejemplo para
>>>>> comparar
>>>>> códigos y encontrar el error.
>>>>>
>>>>> El ejemplo:
>>>>> https://github.com/rstudio/bookdown-demo
>>>>>
>>>>> Javier Rubén Marcuzzi
>>>>>
>>>>>
>>>>> El mar., 17 jul. 2018 a las 18:38, Juan Abasolo (<juan.abasolo using ehu.eus
>>>>> )
>>>>> escribió:
>>>>>
>>>>> Según lo entiendo yo, a mí no me funciona. Lo intenté hacer, también,
>>>>>>
>>>>> en
>>>>
>>>>> la consola directamente. Preferiría poder hacerlo en el documento Rmd,
>>>>>>
>>>>> pero
>>>>
>>>>> de momento ni uno ni otro consigo. Si compila lo hace al libro GitBook
>>>>>>
>>>>> y
>>>>
>>>>> listo. Parece imposible.
>>>>>>
>>>>>> 2018-07-17 20:02 GMT+02:00 Javier Marcuzzi
>>>>>>
>>>>> <javier.ruben.marcuzzi using gmail.
>>>>
>>>>> com>:
>>>>>>
>>>>>> Estimado Juan Abasolo
>>>>>>>
>>>>>>> Yo no lo utilize pero leí algo y me pareció muy buena idea. En otras
>>>>>>> palabras toco de oído.
>>>>>>>
>>>>>>> Pero en la documentación leí algo que podría ser, copio y pego el
>>>>>>> fragmento de texto que sospecho que puede ser útil. A eso me refería
>>>>>>>
>>>>>> en el
>>>>
>>>>> correo anterior, no al yaml.
>>>>>>>
>>>>>>> The pdf_book() format is a general format like html_book(), and it
>>>>>>>
>>>>>> also
>>>>
>>>>> has a base_format argument:
>>>>>>>
>>>>>>> pdf_book(toc = TRUE, number_sections = TRUE, fig_caption = TRUE,
>>>>>>> ..., base_format = rmarkdown::pdf_document, toc_unnumbered = TRUE,
>>>>>>> toc_appendix = FALSE, toc_bib = FALSE, quote_footer = NULL,
>>>>>>> highlight_bw = FALSE)
>>>>>>>
>>>>>>> You can change the base_format function to other output format
>>>>>>> functions, and *bookdown* has provided a simple wrapper function
>>>>>>> tufte_book2(), which is basically pdf_book(base_format =
>>>>>>> tufte::tufte_book), to produce a PDF book using the Tufte PDF style
>>>>>>> (again, see the *tufte* package).
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> El mar., 17 jul. 2018 a las 12:37, Juan Abasolo
>>>>>>> (<juan.abasolo using ehu.eus
>>>>>>>
>>>>>> )
>>>>>
>>>>>> escribió:
>>>>>>>
>>>>>>> Gracias por haberte tomado la molestia de indagar.
>>>>>>>> Entiendo que es eso lo que hago en el encabezado YAML, basandome en
>>>>>>>>
>>>>>>> la
>>>>
>>>>> explicación del comienzo del punto 3 de acá:
>>>>>>>> https://bookdown.org/yihui/bookdown/output-formats.html
>>>>>>>>
>>>>>>>> Eso mismo, con el documento que propone el propio Yihui (punto 1.2
>>>>>>>>
>>>>>>> del
>>>>
>>>>> mismo libro) no lo consigo compilar a PDF. Y se me hace extrañísimo,
>>>>>>>>
>>>>>>> porque
>>>>
>>>>> tampoco me da error ni nada
>>>>>>>>
>>>>>>>>
>>>>>>>> 2018-07-17 15:22 GMT+02:00 Javier Marcuzzi <
>>>>>>>> javier.ruben.marcuzzi using gmail.com>:
>>>>>>>>
>>>>>>>> Estimado Juan
>>>>>>>>>
>>>>>>>>> https://bookdown.org/yihui/bookdown/latexpdf.html en el punto 3.2
>>>>>>>>>
>>>>>>>> ¿no
>>>>
>>>>> le funciona?
>>>>>>>>>
>>>>>>>>> Javier Rubén Marcuzzi
>>>>>>>>>
>>>>>>>>> El mar., 17 jul. 2018 a las 4:32, Juan Abasolo
>>>>>>>>>
>>>>>>>> (<juan.abasolo using ehu.eus>)
>>>>
>>>>> escribió:
>>>>>>>>>
>>>>>>>>> Buenas, foreros y foreras;
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> No sé si esto es pregunta para hacer acá, lo preguntaría en
>>>>>>>>>> stackoverfow,
>>>>>>>>>> si no fuese que el inglés me intimida.
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Quiero usar el packete `bookdown` para escribir un libro, pero
>>>>>>>>>> resulta que
>>>>>>>>>> la salida tiene que ser PDF y no lo consigo.
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Siguiendo las instrucciones de acá:
>>>>>>>>>> https://bookdown.org/yihui/bookdown/get-started.html
>>>>>>>>>> llego a compilar sin ningún problema en formato GitBook. Que está
>>>>>>>>>> buenísimo
>>>>>>>>>> y lo recomiendo, pero no consigo sacar un pdf.
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Cambié el encabezado YAML así:
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> ---
>>>>>>>>>> title: "A Minimal Book Example"
>>>>>>>>>> author: "Yihui Xie"
>>>>>>>>>> date: "`r Sys.Date()`"
>>>>>>>>>> site: bookdown::bookdown_site
>>>>>>>>>> output:
>>>>>>>>>> bookdown::pdf_book:
>>>>>>>>>> documentclass: book
>>>>>>>>>> bibliography: [book.bib, packages.bib]
>>>>>>>>>> biblio-style: apalike
>>>>>>>>>> link-citations: yes
>>>>>>>>>> github-repo: rstudio/bookdown-demo
>>>>>>>>>> description: "This is a minimal example of using the bookdown
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>> package
>>>>
>>>>> to
>>>>>>>>>> write a book. The output format for this example is
>>>>>>>>>> bookdown::gitbook."
>>>>>>>>>> ---
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Claro está que lo quiero hacer sobre el modelo que propone Yihui
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>> Xie.
>>>>
>>>>> El
>>>>>>>>>> cambio sobre el original está en las lineas:
>>>>>>>>>> output:
>>>>>>>>>> bookdown::pdf_book:
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Consigo sin problemas sacar RMarkdown a PDF, por si surge la duda.
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Estoy usando ahora:
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> * KUbuntu 18.04
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> * RStudio 1.1.453
>>>>>>>>>> * bookdown 0.7
>>>>>>>>>> * RMarkdown 1.10
>>>>>>>>>> * tinytex 0.6 (me hacía falta ponerlo?)
>>>>>>>>>> * TexLive (desde repositorios, operativo y funciona bien solo y
>>>>>>>>>> con
>>>>>>>>>> LyX -y
>>>>>>>>>> RMarkdown-)
>>>>>>>>>> * Pandoc 2.2.1-1 (bajado desde su página)
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Si alguien entiende qué pasa, agradezco que me ilumine.
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Juan
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> --
>>>>>>>>>> Juan Abasolo
>>>>>>>>>>
>>>>>>>>>> Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila
>>>>>>>>>> Bilboko Hezkuntza Fakultatea
>>>>>>>>>> Euskal Herriko Unibertsitatea
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>>>>>>>>>> Bizkaia
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>>>>>>>>>> [[alternative HTML version deleted]]
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> Marcelino de la Cruz Rot
> Depto. de Biología y Geología
> Física y Química Inorgánica
> Universidad Rey Juan Carlos
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