[R-es] Subset dentro de un for

[Manuel Mendoza]

Gracias Marcelino. Si, (i in 1:length(GT)), lo he utilizado mil veces,  
pero se me sigue olvidando de una vez a otra. Lo iba a mirar, pero me  
centré primero en que me hiciera bien el mapa.

He probado el for y me da este error:

Error in aes(x = lon, y = lat, color = get(GT[i]), size = 2) +  
scale_colour_gradient(low = ("white"),  :
   non-numeric argument to binary operator




Quoting Marcelino De La Cruz Rot <marcelino.delacruz using urjc.es>:

> Ten cuidado, porque empiezas el for como:
>
> for(i in GT)
>
> y luego el color del aes lo defines como:
>
> color= GT[i]
>
> Lo que, por ejemplo para el primer caso, se traduciría  en GT["var1"],
> que, a no ser que GT tenga names , debería dar un error.
>
> Yo creo que quieres decir
>
> for(i in 1:length(GT))
>
> ...
> color=get(GT[i])
>
>
> El 12/12/2018 a las 18:21, Manuel Mendoza escribió:
>>
>> Gracias a los tres, Raúl, Marcelino y Carlos.
>>
>> Lo del "get" de Marcelino me da la respuesta a lo que yo exactamente
>> preguntaba, y funciona, pero ahora tengo problemas con el for, por lo
>> que probablemente recurra al eval parse de Raúl o Carlos, que ya
>> tienen el for. Aún así, lo intento 1º con el get.
>>
>> Con subset(df, subset=get(GT[i])>0) el problema es que en el for hago
>> un ggplot cuyo color es = a la variable que condiciona el subset, y no
>> funciona poniendo GT[i] (como se ve abajo). Pretendo que me haga 20
>> mapas, cada uno de acuerdo a una de las 20 variables de GT.
>>
>> GT<- c("var1","var2", … "var20")
>>
>> for(i in GT) {
>>
>> df2<-subset(df1, subset=get(GT[i])>0)
>>
>> windows();print(ggplot(legend=FALSE)+geom_path( data=world,
>> aes(x=long, y=lat,group=group))+
>> theme(panel.background=element_blank())+theme(panel.grid.major =
>> element_blank())+
>>         theme(panel.grid.minor =
>> element_blank())+theme(axis.text.x=element_blank(),axis.text.y=element_blank())+
>>         theme(axis.ticks = element_blank())+xlab("") + ylab("")+
>>         geom_point(data=df2,aes(x=lon,y=lat,
>>
>>         color= GT[i],size=2) +
>>
>> scale_colour_gradient(low=("white"),high=("red"),guide="colourbar",limits=c(0,max))+
>>         geom_path(data=map_data('world'), aes(x=long,
>> y=lat,group=group))+
>>         labs(title =  paste("5026 Minimum number of IFd species to go
>> extinct"))))
>>
>> }
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> Quoting Carlos Ortega <cof using qualityexcellence.es>:
>>
>>> Esta es una forma...
>>>
>>>> for(i in c('Ozone', 'Solar.R')) {
>>> +   print(i)
>>> +   sub_data <- subset(airquality, eval(parse(text=i)) < 100)
>>> +   res_ult <- mean(sub_data$Temp, na.rm = TRUE)
>>> +   print(res_ult)
>>> + }
>>> [1] "Ozone"
>>> [1] 77.34862
>>> [1] "Solar.R"
>>> [1] 71.85294
>>>
>>> Y otra forma à la dplyr...:
>>>
>>>> library(rlang)
>>>> for(i in c('Ozone', 'Solar.R')) {
>>> +   print(i)
>>> +   res_ult <- airquality %>%
>>> +     filter(!!sym(i) < 100) %>%
>>> +     summarize(Media = mean(Temp, na.rm = TRUE))
>>> +   print(res_ult)
>>> + }
>>> [1] "Ozone"
>>>      Media
>>> 1 77.34862
>>> [1] "Solar.R"
>>>      Media
>>> 1 71.85294
>>>
>>> Saludos,
>>> Carlos Ortega
>>> www.qualityexcellence.es
>>>
>>>
>>>
>>> El mié., 12 dic. 2018 a las 14:09, Manuel Mendoza
>>> (<mmendoza using mncn.csic.es>)
>>> escribió:
>>>
>>>> Muy buenas.  Quiero hacer un loop en el que en cada iteración se hace
>>>> un subset con el que se queda con las muestras para la que cierta
>>>> variable es positiva.
>>>>
>>>> Si hago esto, sale bien:
>>>>
>>>> df2<-subset(df, subset = var1>0)
>>>>
>>>>
>>>> Pero he probado así (y de no sé cuantas formas más), antes de hacer el
>>>> for, y no sale:
>>>>
>>>> GT<- c("var1","var2", … )
>>>>
>>>> df2<-subset(df, subset=(GT[1]>0))
>>>>
>>>> Gracias,
>>>> Manuel
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>>
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>>>>
>>>> --
>>>> Dr Manuel Mendoza
>>>> Department of Biogeography and Global Change
>>>> National Museum of Natural Science (MNCN)
>>>> Spanish Scientific Council (CSIC)
>>>> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
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>>>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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>>> --
>>> Saludos,
>>> Carlos Ortega
>>> www.qualityexcellence.es
>>
>>
>
> --
> Marcelino de la Cruz Rot
> Depto. de Biología y Geología
> Física y Química Inorgánica
> Universidad Rey Juan Carlos
> Móstoles España


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Dr Manuel Mendoza
Department of Biogeography and Global Change
National Museum of Natural Science (MNCN)
Spanish Scientific Council (CSIC)
C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
Spain