[R-es] AYUDA TukeyHSD

[Marcelino de la Cruz Rot]

Hola,
Al parecer estás intentando hacer in post-hoc test de una interacción. 
Por definición(ver la página de ayuda), eso no se puede hacer con la 
función TukeyHSD (que está diseñada para contrastar factores individuales).

Contrastes de interacciones se pueden realizar con el paquete multcomp o 
de forma más sencilla con paquete phia, que está diseñado 
específicamente para contrastar interacciones:
cran.r-project.org/web/packages/phia/vignettes/phia.pdf

Un saludo,

Marcelino


El 10/01/2017 a las 21:54, Emilio L. Cano escribió:
> Hola,
>
> Una forma rápida de convertir todos los nombres de columnas una vez
> importados los datos es:
>
> names(nombredeldataframe) <- make.names(names(nombredeldataframe)
>
> Un saludo,
> Emilio
>
>
> El 10 de enero de 2017, 19:51, Carlos J. Gil Bellosta <cgb en datanalytics.com>
> escribió:
>
>> Primero, deberías hacer
>>
>> TukeyHSD(ANOVAGalMan3, "Sample*`Purification-step`",ordered = TRUE)
>>
>> Segundo, ni eso te va a funcionar. Cambia el nombre de tus columnas para
>> que no tengan guiones ni tengas que usar comillas.
>>
>> Arrastrar nombres con caracteres inválidos es garantía de problemas.
>>
>> Un saludo,
>>
>> Carlos J. Gil Bellosta
>> http://www.datanalytics.com
>>
>> El 10 de enero de 2017, 19:34, Pilar Vilaro <pilarvilaro en gmail.com>
>> escribió:
>>
>>> Hola,
>>> estoy intentando hacer un Tukey post test y no me lo permite.
>>> Hice el anova con aov sin problemas, pero al hacer el Tukey, me dice:
>>>
>>>> TukeyHSD(ANOVAGalMan3,Sample*`Purification-step`,ordered = TRUE)Error
>>> in `[.data.frame`(mf, mf.cols[[i]]) : undefined columns selected
>>>
>>>
>>> aclaro que ANOVAGalMan3 es el resultado de anova.
>>>
>>> la tabla origen tiene la estructura:
>>>
>>> Sample Purification-step Total-sugar-content Total-protein-content
>>> G-M-ratio
>>> Prosopis affinis Yo 63,5 4,2 1,4
>>>
>>> y tiene algunos datos faltantes que aparecen como NA
>>>
>>> alguno puede ayudarme?
>>> muchas gracias saludos
>>>
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Marcelino de la Cruz Rot
Depto. de Biología y Geología
Física y Química Inorgánica
Universidad Rey Juan Carlos
Móstoles España


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