[R-es] paquete Rcmdr y BiodiversityR
Luis E
luisespo00 en hotmail.com
Mie Feb 15 18:52:02 CET 2017
Estimados,
Muchas gracias por sua ayuda, ya pude instalar data.table y esta funcionando.
Respecto al paquete biodiversityR, no se porque ahora no me corre. El script esta correcto, pero no se porque me tira error.
> fase<-diversitycomp(biobsp, y=biopcat,factor1="Fase",index="richness",method=“s")
Error in diversitycomp(biobsp, y = biopcat, factor1 = "Fase", index = "richness", :
choose an accepted method, not method: s
Gracias a ambos por su ayuda.
Saludos, Luis
El 15 feb. 2017, a las 12:44, Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es<mailto:cof en qualityexcellence.es>> escribió:
Ya...
El problema que pareces tener en tu Mac es que no tienes ninguna librería de desarrollo instalada y no puedes compilar data.table.
¿Tienes instalado el Xcode?.
Es la aplicación de desarrollo (gratuita) para Mac del propio Apple. Esta aplicación contiene diferentes compiladores que te permitirán compilar el paquete y otros muchos que necesiten de esta compilación. Para conseguir "Xcode" tienes que ir a "Actualización de software..." y dentro de "Comprado" te debiera de aparecer. O vaya en tu acceso al AppStore búscala e instálala...
Cuando la instales, la abres y la cierras, de esta forma ya se aplican todas las variables de configuración, que permitirán ya decir al compilador de "R" donde buscar los compiladores necesarios.
Y ya tras hacer esto, podrás compilar data.table...
Saludos,
Carlos Ortega
2017-02-15 16:36 GMT+01:00 Luis E <luisespo00 en hotmail.com<mailto:luisespo00 en hotmail.com>>:
Gracias Carlos,
ya intente instalar varias veces el paquete data.table, pero no se porque no lo puede instalar
Aqui mando la salida:
> install.packages("data.table")
There is a binary version available but the source version is later:
binary source needs_compilation
data.table 1.10.0 1.10.4 TRUE
Do you want to install from sources the package which needs compilation?
y/n: y
installing the source package 'data.table'
probando la URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/data.table_1.10.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 3068135 bytes (2.9 MB)
==================================================
downloaded 2.9 MB
Durante la inicializaci'on - Warning messages:
1: Setting LC_CTYPE failed, using "C"
2: Setting LC_TIME failed, using "C"
3: Setting LC_MESSAGES failed, using "C"
4: Setting LC_MONETARY failed, using "C"
* installing *source* package 'data.table' ...
** package 'data.table' successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
xcrun: error: invalid active developer path (/Library/Developer/CommandLineTools), missing xcrun at: /Library/Developer/CommandLineTools/usr/bin/xcrun
ERROR: compilation failed for package 'data.table'
* removing '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.3/Resources/library/data.table'
Warning in install.packages :
installation of package 'data.table' had non-zero exit status
The downloaded source packages are in
'/private/var/folders/wc/fkdhnf4j27z9h3s2bck8ntxh0000gn/T/RtmpvGHO4t/downloaded_packages'
El 15 feb. 2017, a las 12:28, Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es<mailto:cof en qualityexcellence.es>> escribió:
El error que estás teniendo te dice que lo que te falta es el paquete "data.table"....
Prueba a instalar este paquete y lánzalo de nuevo.
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es/>
El 15 de febrero de 2017, 15:58, Luis E <luisespo00 en hotmail.com<mailto:luisespo00 en hotmail.com>> escribió:
Estimados,
Soy usuario de Mac y desde que instale la nueva version de R y Rstudio, no puedo cargar el paquete Rcmdr. Lo miso me pasa con el paquete BiodiversityR.
Alguien tiene alguna posible solución?
Desde ya muchas gracias.
Saludos, Luis
> library(Rcmdr)
Loading required package: RcmdrMisc
Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) :
there is no package called 'data.table'
Error: package 'RcmdrMisc' could not be loaded
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