[R-es] Representar datos longitudinales mediante splines

[Olivier Nuñez]

Prueba esto:

ggplot(df,aes(x,x,y=y,color=id))+geom_smooth(method="gam")+geom_point()

Un saludo. Olivier

----- Mensaje original -----
De: "Francisco Javier" <iterador10 en hotmail.com>
Para: r-help-es en r-project.org
Enviados: Jueves, 3 de Marzo 2016 21:35:57
Asunto: [R-es] Representar datos longitudinales mediante splines

Buenas noches a todos,


Me dirijo a vosotros porque estoy trabajando con medidas repetidas sobre un grupo de sujetos y quisiera graficar la evoluci�n temporal de cada uno de ellos pero suavizada mediante un spline (o en su defecto alg�n tipo de l�nea suavizadora que no necesariamente tenga que pasar por los puntos de cada sujeto). Adem�s, quisiera hacerlo en R b�sico, esto es, sin recurrir al uso de paquetes adicionales tipo lattice,  ggplot2.


A modo de ejemplo, tengo el siguiente data frame:


df <- data.frame(

                id = factor(rep(c(1,2,3), c(3,4,3))),
                x = c( 1, 14, 22,  2, 9,  20, 25,  4,  15,  22),
                y = c(35, 28, 52, 79, 64, 70, 95, 45, 102, 105))


E intento (sin conseguir resultado):


plot(df$x, df$y, xlab = "time", ylab="value", type="n", xlim = c(0,25), ylim=c(20,120))
for(i in unique(df$id)) {
 lines(lowess(df$x[df$id == i], df$y[df$id == i], col = df$id))  }
points(x = df$x, y = df$y, pch=16, col = df$id)              # Los datos asociados a cada id con un color de referencia
title("Scatter Plot of value vs. time")


�Muchas gracias por cualquier ayuda al respecto!


Francisco

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