[R-es] Comparación de probabilidades de supervivencia en R

Manuel Spínola mspinola10 en gmail.com
Jue Ago 11 15:53:30 CEST 2016


Muchas gracias Javier y Carlos.

multcomp es lo que estaba buscando.

Manuel

El 11 de agosto de 2016, 7:50, Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
escribió:

> Hola,
>
> Puedes mirar esto:
>
> https://cloud.r-project.org/web/packages/multcomp/index.html
>
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
> El 11 de agosto de 2016, 14:49, Manuel Spínola <mspinola10 en gmail.com>
> escribió:
>
>> Estimados miembros de la lista,
>>
>> Estoy haciendo una análisis de supervivencia con R.  Adjunto mis datos.
>> Quiero analizar la supervivencia de 5 grupos diferentes y compararla. Para
>> ello estoy utilizando el paquete survival.
>>
>>
>> > s = Surv(c$tiempo, c$estado)
>> > f = survfit(s ~ tratamiento, data = c)
>> > d = survdiff(s ~ tratamiento, data = c)
>> > d
>> Call:
>> survdiff(formula = s ~ tratamiento, data = c)
>>
>>                     N Observed Expected (O-E)^2/E (O-E)^2/V
>> tratamiento=h+s    18       15     12.0    0.7499    1.1362
>> tratamiento=hojas  17       10     14.4    1.3365    2.1327
>> tratamiento=lombri 15       11     11.3    0.0104    0.0156
>> tratamiento=saran  18       15     13.9    0.0801    0.1254
>> tratamiento=sin    30       23     22.3    0.0202    0.0369
>>
>>  Chisq= 2.8  on 4 degrees of freedom, p= 0.59
>>
>>
>> Mi pregunta es hay alguna forma de comparar la probabilidad de
>> supervivencias (en este caso anual) entre grupos sin utilizar un
>> chi-cuadrado y un valor de P. Entiendo que lo que hace survdiff es
>> comparar
>> las curvas de supervivencia, pero yo quiero comparar la probabilidad de
>> supervivencia entre grupos al final del estudio.
>>
>> Por ejemplo, estas son las probabilidades de supervivencia de cada grupo
>> al
>> final de 379 dás.
>>
>> Grupo 1: 0.167  95% CI: 0.0593 - 0.468
>> Grupo 2: 0
>> Grupo 3: 0.267 95% CI:  0.115 - 0.617
>> Grupo 4: 0.167 95% CI: 0.0593 - 0.468
>> Grupo 5: 0.233 95%CI: 0.122 - 0.446
>>
>> Como comparar esas probabilidades de supervivencia?
>>
>> Muchas gracias,
>>
>> Manuel
>>
>>
>>
>> --
>> *Manuel Spínola, Ph.D.*
>> Instituto Internacional en Conservación y Manejo de Vida Silvestre
>> Universidad Nacional
>> Apartado 1350-3000
>> Heredia
>> COSTA RICA
>> mspinola en una.cr <mspinola en una.ac.cr>
>> mspinola10 en gmail.com
>> Teléfono: (506) 8706 - 4662
>> Personal website: Lobito de río <https://sites.google.com/site
>> /lobitoderio/>
>> Institutional website: ICOMVIS <http://www.icomvis.una.ac.cr/>
>>
>>         [[alternative HTML version deleted]]
>>
>> _______________________________________________
>> R-help-es mailing list
>> R-help-es en r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>>
>
>
>
> --
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>



-- 
*Manuel Spínola, Ph.D.*
Instituto Internacional en Conservación y Manejo de Vida Silvestre
Universidad Nacional
Apartado 1350-3000
Heredia
COSTA RICA
mspinola en una.cr <mspinola en una.ac.cr>
mspinola10 en gmail.com
Teléfono: (506) 8706 - 4662
Personal website: Lobito de río <https://sites.google.com/site/lobitoderio/>
Institutional website: ICOMVIS <http://www.icomvis.una.ac.cr/>

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