[R-es] Procesos paralelos
miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es
miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es
Mar Abr 12 11:55:13 CEST 2016
Hola José Luis.
Te da algún error? o simplemente no aparece la barra de progreso?
... y si, en vez de usar winProgressBar(), pruebas con la función tkProgressBar() del paquete tcltk ¿?
Un saludo,
Miguel.
El 12/04/2016 a las 11:04, Gilsanz, Jose Luis escribió:
Hola:
Vuelvo a la carga con algo que resolv� hace a�os y que ahora me ha dejado de funcionar y no consigo arreglar. A ver si alguien me sugiere alg�n enfoque o directamente la solucion.
Utilizo R en muchos procesos ETL y la cuesti�n es que me encuentro con que tengo que hacer inserts en un BBDD de SQL Server de varios miles (a veces millones de registros) que mientras R las realiza parece que no est� haciendo nada.
La soluci�n que consegu� hacer en su momento fue paralelizar el proceso de inserci�n en dos procesos distintos usando el paquete snowfall.
-Un proceso se encargaba de la propia inserci�n de los datos.
-El otro proceso mostraba una barra de progreso que se constru�a consultando la tabla (tab) donde se insertaban los registros (datos) para monitorizar su proceso.
La subida al servidor es esta funci�n:
subida <- function( datos, tab)
{
flush.console()
canal2 <- odbcDriverConnect( "case=nochange; Driver=xxx; Server=xxx; Database=xxx; uid=xxx; pwd=xxx; wsid=xxx;")
sqlSave(canal2,datos,tablename= tab, rownames = FALSE, append=TRUE, fast=TRUE )
close(canal2)
rm(canal2)
}
La barra de progreso se toma de esta funci�n:
pb <-function( datos,tab){
##Creamos canal de conexion a BBDD
canal1 <- odbcDriverConnect( "case=nochange; Driver=SQL Server; Server=xxx; Database=xxx; uid=xxx; pwd=xx; wsid=ESMADN1003;;")
##Obtenemos conteos de registros##################
#Numero de registro que se van a cargar
asubir <- as.numeric(nrow(datos))
#Numero de registro que ya hay en la tabla
entabla <- as.numeric(sqlQuery(canal1,paste("SELECT Count(*) ", " FROM ",tab, sep="")))
#Numero de registros cargados en el momento n
total <- as.numeric(0)
#Frecuenca de actualizacion de la barra
frec <- 0.1
##Creamos barra de progreso
barra <- winProgressBar(title="Subiendo datos a SQL ", label = "Subido el: ", min= 0, max= 1,initial= 0, width = 800)
##Mientras los registros que quedan por subir sean inferiores a los que actualmente hay en la tabla se muestra la barra
while ( entabla + asubir > total )
{
#Reconectamos
canal1 <- odbcReConnect(canal1)
#Obtenemos registros actuales en la tabla (los que habia + los que han subido hasta el momento)
total <- as.numeric(sqlQuery(canal1,paste("SELECT Count(*) FROM ",tab, sep="")))
#Calculamos porcentaje de registros subidos en el momento
porcen <- as.numeric((total - entabla) / asubir)
#Actualizamos barra de progreso
setWinProgressBar(barra, porcen,title="SUBIENDO DATOS A SQL", label =paste("Subido el: ", round(porcen *100,0), "% de los datos. Quedan por subir ",(entabla + asubir)-total, " registros de ", asubir, "." , sep=""))
#Actualizamos consola
flush.console()
Sys.sleep(frec)
}
close(barra)
}
Ahora estoy intentando usar el paquete parallel (en lugar de snowfall que ya no me funciona) haciendo esto.
library(parallel)
library(RODBC)
##Creo un cluster con dos nodos
cl <-makeCluster(2)
##Exporto datos y funciones a los dos cluster
clusterExport(cl,varlist=c("pb","subida","datos","tab"))
##En el primer cluster hago la inserci�n en el segundo la barra de progreso
clusterApply(cl,subida(datos,tab),pb(datos,tab) )
La inserci�n la realiza correctamente pero la barra de progreso no aparece por ning�n lado :( y en el monitor de procesos aparecen dos Rscript.exe corriendo (uso Windows 7)
Si alguien quiere que le proporcione la funci�n que constru� usando snowfall (y que ahora tampoco muestra la barra) se la puedo enviar para destriparla.
Muchas gracias
Un saludo
Jos� Luis Gilsanz G�mez
Estad�stica
Departamento T�cnico Entidades Financieras
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Paseo de la Castellana 130 - 1�; 28046 Madrid
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