[R-es] sobre fread {data.table}
MªLuz Morales
mlzmrls en gmail.com
Mie Sep 30 10:37:18 CEST 2015
Hola de nuevo,
el archivo .rel esta en una carpeta comprimida .zip, yo la descomprimo con
win rar. Como no sea ese el motivo por el que no me da el fichero completo?
El 30 de septiembre de 2015, 10:30, MªLuz Morales <mlzmrls en gmail.com>
escribió:
> Pues soy gafe entonces,
> no lo entiendo:
>
> > datIn <- fread("C:\\Users\\iphealthMariluz\\Documents\\Proyecto iphealt\\ProcesamientoTexto\\Adverse Drug Event\\ADE-Corpus\\DRUG-AE.rel")> dim(datIn)[1] 1855 8
>
>
> El 29 de septiembre de 2015, 18:54, Carlos Ortega <
> cof en qualityexcellence.es> escribió:
>
>> Y con fread.. directamente sobre el ".rel"...
>>
>> > datIn <- fread("DRUG-AE.rel")
>> > dim(datIn)
>> [1] 6821 8
>>
>>
>>
>> Saludos,
>> Carlos Ortega
>> www.qualityexcellence.es
>>
>>
>> El 29 de septiembre de 2015, 18:45, Pedro Concejero Cerezo <
>> pedro.concejerocerezo en telefonica.com> escribió:
>>
>>> No tiene cabecera. Tendrás que ponerle nombre a las variables
>>> Prueba este código, yo leo 6821 obs. of 8 variables
>>>
>>> library(data.table)
>>> setwd("C:/Users/pedroc/Desktop/ADE-Corpus-V2") #Pon tu directorio trabajo
>>> dat <- read.table(file = "DRUG-AE.rel",
>>> sep = "|",
>>> comment.char = "",
>>> header = F,
>>> quote = "")
>>>
>>> str(dat)
>>>
>>> datt <- data.table(dat)
>>>
>>>
>>> El 29/09/2015 a las 17:31, Pedro Concejero Cerezo escribió:
>>> Hola, M. Luz.
>>> Hay infinidad de motivos por los que se te puede cortar la lectura de un
>>> archivo de datos, pero los más habituales son encontrar un "#" o unas "" en
>>> los registros, o una línea toda en blanco.
>>> Lo primero yo creo que es dejar el archivo en texto plano (lo que te
>>> recomendaba Carlos de usar el original, no el docx), y buscar esos
>>> caracteres con un editor de texto plano tipo Notepad. Los puedes eliminar
>>> si no cumplen ninguna función.
>>> Yo te recomiendo usar read.table que te permite configurar estos
>>> detalles. En concreto:
>>>
>>> comment.char = "" no te corta la lectura de fichero como si fuera un
>>> comentario, te lo añade a la cadena (eso si quieres usar el carácter, si no
>>> elimínalo)
>>> quote = "" lo mismo con la comilla como comienzo de una cadena
>>>
>>> Pero verás que hay muchísimas más opciones que te evitan que se corte la
>>> lectura (blank lines, ...) o que te rellene con NA's si no encuentra todas
>>> las columnas del header (flush = TRUE).
>>> Luego pasas a data.table con data.table(objeto_que_has_leido) y ya está.
>>>
>>> read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"'",
>>> dec = ".", numerals = c("allow.loss", "warn.loss", "no.loss"),
>>> row.names, col.names, as.is = !stringsAsFactors,
>>> na.strings = "NA", colClasses = NA, nrows = -1,
>>> skip = 0, check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip,
>>> strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,
>>> comment.char = "#",
>>> allowEscapes = FALSE, flush = FALSE,
>>> stringsAsFactors = default.stringsAsFactors(),
>>> fileEncoding = "", encoding = "unknown", text, skipNul =
>>> FALSE)
>>>
>>>
>>> Saludos,
>>> Pedro
>>>
>>> =============
>>> En respuesta a:
>>>
>>> ------------------------------
>>>
>>> Message: 2
>>> Date: Tue, 29 Sep 2015 16:55:05 +0200
>>> From: MªLuz Morales <mlzmrls en gmail.com><mailto:mlzmrls en gmail.com>
>>> To: r-help-es <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org>
>>> Subject: [R-es] sobre fread {data.table}
>>> Message-ID:
>>> <
>>> CANmAToM+sRRTfOBRYsrgoUdxdXVtrk21_E7LE0rrb8ENmMiBqQ en mail.gmail.com
>>> ><mailto:
>>> CANmAToM+sRRTfOBRYsrgoUdxdXVtrk21_E7LE0rrb8ENmMiBqQ en mail.gmail.com>
>>> Content-Type: text/plain; charset="UTF-8"
>>>
>>> Buenas tardes,
>>>
>>> intento almacenar el contenido de un archivo .docx en un data.table, pero
>>> solo me devuelve 1855 filas cuando deberñian ser 6821.
>>>
>>> Sin embargo, el mismo archivo se me descarga completo usando read_docx
>>> {qdapTools}, pero este devuelve un vector carácter y no es lo que quiero.
>>>
>>> ¿Alguien sabe donde puede estar el problema?
>>>
>>> Nota: El docx procede de un archivo .rel que descargué de internet, al
>>> cual
>>> cambié la extensión por .doc y una vez abierto guardé como docx.
>>>
>>> Gracias!!
>>> Un saludo
>>> MªLuz
>>>
>>>
>>> --
>>> Pedro Concejero
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>>> Entusiasta R, me encontraréis aquí gRupo R madRid <
>>> http://madrid.r-es.org/>
>>>
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