[R-es] NetCDF

Marina Peña Gallardo marinapgallardo en gmail.com
Mar Mar 24 13:55:27 CET 2015


Buenas tardes,

pido disculpas si mi consulta es demasiado elemental, pero actualmente
encuentro una gran barrera para continuar mi trabajo si no lo solvento.

Soy usuaria principiante de R, estoy trabajando con una base de datos
climática <https://digital.csic.es/handle/10261/104742>que se encuentra en
formato netcdf4 y necesito transformarla a la versión 3 con el fin de
visualizarlo en un SIG. Para ello sé de la existencia de una orden en el
paquete NetCDF4 que me lo permitiría pero el problema viene a la hora de
instalar los paquetes.

*1º-* instalo el paquete 'ncdf' desde Rstudio -> Tools/Install
Packages/Repository/ncdf

​

*2º.* Instalado este paquete, procedo a instalar el paquete ncdf4:

http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/

En mi caso el archivo para MS Windows (64-bit R version 3.1.0)

Y este es el mensaje que aparece:

> install.packages("C:/Users/MRN/Downloads/ncdf4_1.12.tar.gz", repos =
NULL, type = "source")
Installing package into ‘C:/Users/MRN/Documents/R/win-library/3.1’
(as ‘lib’ is unspecified)
* installing *source* package 'ncdf4' ...
** package 'ncdf4' successfully unpacked and MD5 sums checked

**********************************************
WARNING: this package has a configure script
It probably needs manual configuration
**********************************************


** libs
Aviso: comando ejecutado 'make -f "Makevars.win" -f
"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.3/etc/x64/Makeconf" -f
"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.3/share/make/winshlib.mk" SHLIB="ncdf4.dll" WIN=64
TCLBIN=64 OBJECTS="ncdf.o ncdf2.o ncdf3.o src_ncdf4.o"' tiene estatus 127
ERROR: compilation failed for package 'ncdf4'
* removing 'C:/Users/MRN/Documents/R/win-library/3.1/ncdf4'
* restoring previous 'C:/Users/MRN/Documents/R/win-library/3.1/ncdf4'
Warning in install.packages :
running command '"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.3/bin/x64/R" CMD INSTALL -l
"C:\Users\MRN\Documents\R\win-library\3.1"
"C:/Users/MRN/Downloads/ncdf4_1.12.tar.gz"' had status 1
Warning in install.packages :
installation of package ‘C:/Users/MRN/Downloads/ncdf4_1.12.tar.gz’ had
non-zero exit status
>

Además de ello, cuando ejecuto el comando de la librería de 'ncdf' que nada
tiene que ver con el paquete ncdf4, para abrir un .nc de versión 3, me sale
lo siguiente:

Error in R_nc_open: NetCDF: Unknown file format

Error in open.ncdf("SPEI_01.nc")


He consultado múltiples páginas del CRAN, y foros pero no consigo entender
la solución.



Muchas gracias de antemano y disculpen mi inexperiencia con la programación.


*SessionInfo:*

R version 3.1.3 (2015-03-09)

Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

Running under: Windows 8 x64 (build 9200)
-- 
*Marina Peña Gallardo*
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