[R-es] Pregunta sobre RMarkdown

Jue Jul 2 16:18:20 CEST 2015

Hola David,
En principio para html, funciona muy bien RMarkdown en el entorno en el que estoy, donde hay antivirus y temas de seguridad e historias que pueden cortarme las alas.
Sin embargo lo que estoy preguntando en origen es si puedo generar multiples html llamando a un fichero .Rmd donde se cambie un parametro que ademas esta dentro de una chunck (imagino que trivial no es)
Al hilo de las pruebas realizadas en la indicacion dada por Carlos (donde se sugiere hacer lo anterior via Pandoc lo que una vez que funcione no se a donde me llevara), he recordado otro problema que tenia y era la generacion de pdf directamente. Para ello se requiere software extra que creo haber instalado, pero sin embargo, aun no consigo que se genere un fichero en pdf usando meramente markdown y me aparecia, tanto con Pandoc, como con RMarkdown los errores que os he comentado anteriormente.
En todo caso cualquier ayuda al respecto es bienvenida, veo una herramienta muy potente y que simplemente, por desconocimiento mio o por problemas tecnicos que escapan a mi alcance, no puedo explotar, bajo entorno r toda la funcionalidad
Un saludo y si consigues algo te lo agradezco, aunque yo he mirado tambien cosas
Gracias

Date: Thu, 2 Jul 2015 09:08:02 -0500
Subject: Re: [R-es] Pregunta sobre RMarkdown
From: dhduncan1975 en gmail.com
To: fjroar en hotmail.com
CC: cof en qualityexcellence.es; r-help-es en r-project.org

Francisco, 

¿Así que todo que quieres imprimir a html o pdf sea contenido dentro de un solo chunk?  Quizás por mis limitaciones en el español no veo muy claro si tu problema pertenece específicamente a markdown o no. 

Yo busco una solución parecida en inglés el otro día, porque quiero generar y guardar en archivo conjuntos de datos ligeramente distintos para mis estudiantes (los que son mayoritariamente copiones).  De modo que conseguiré este tema, y te aviso si encuentro algo por StackOverflow.

2015-07-02 8:33 GMT-05:00 Francisco Rodríguez <fjroar en hotmail.com>:
Hola Carlos, creo que no resuelve el problema, de hecho otra de las cosas que no he conseguido aún es generar sencillamente el PDF (con los html para generarlos 1 a 1 sin pb).

Siempre suelo obtener el error. Esto me aparece al ejecutar myReport$export():

You may install Pandoc easily with "install.pandoc()" from the "installr" package.Error in Pandoc.convert(fp, format = .self$format, proc.time = as.numeric(proc.time() -  :   It seems Pandoc is not installed or path of binary is not found.

Es cierto que el ordenador que estoy usando es el del trabajo y seguro que por tema de antivirus puede que haya algún problema (además de que mi torpeza), pero tengo instalado el Pandoc, y he reiniciado la máquina y estoy actualizado a la última versión de R y RStudio

Además al seguir el ejemplo que aparece donde indicas, me aparece el siguiente mensaje cuando ejecuto por ejemplo myReport$add(matrix(5,5,5));

Dicho error es: Error: cannot allocate buffer

Probaré desde mi casa a si pillo algo de tiempo y ya os cuento, pero sobre el problema inicial creo que aunque resolviese los anteriores errores aún quedaría abierto porque en no consigo ver cómo a partir del ejemplo pasar a lo que quiero.

Un saludo y en todo caso muchas gracias, estoy mirando cosas por mi cuenta a ver si lo resuelvo

Date: Thu, 2 Jul 2015 12:02:57 +0200

Subject: Re: [R-es] Pregunta sobre RMarkdown

From: cof en qualityexcellence.es

To: fjroar en hotmail.com

CC: r-help-es en r-project.org

Hola Francisco,

Puedes utilizar el paquete "pander" para hacer lo que buscas.

Es equivalente a knitr para generar código markdown que luego con Pandoc (lo tienes que tener instalado en tu equipo) genere el pdf o el html final.

Como ejemplo mira en su página:

http://rapporter.github.io/pander/

la sección "Live report generation" en la que aparece detallado y comentado un ejemplo.

Puedes tener un programa "R" que de forma dinámica genere vía comandos "pander" cada uno de los informes que quieres.

Saludos,

Carlos Ortega

www.qualityexcellence.es

El 2 de julio de 2015, 9:43, Francisco Rodríguez <fjroar en hotmail.com> escribió:

Hola buenos dias, tengo una duda con RMarkdown que no se si tiene facil apanio.

Resulta que para un trabajo que estoy haciendo necesito que se ejecute el siguiente codigo n-veces

```{r echo = FALSE}

ANIO_ACTUAL<-2015

i=1

CONFIGURACION <-read.csv("D:\\  …  \\CONFIGURACION.csv",sep

= ",")

AYUNT <- as.character(CONFIGURACION$AYUNTAMIENTO[i])

```

##Situación de `r AYUNT`

Al ejecutar este código genera un fichero html que podemos denominar:

                                      Ejemplo.html

Tal y como está escrito el programa, si quiero ejecutar para el siguiente ayuntamiento tengo que hacer lo siguiente:

```{r echo = FALSE}ANIO_ACTUAL<-2015i=2CONFIGURACION <-read.csv("D:\\  …  \\CONFIGURACION.csv",sep = ",")AYUNT <- as.character(CONFIGURACION$AYUNTAMIENTO[i])```##Situación de `r AYUNT`

Es decir, cambio el parametro i y tengo la generación de un nuevo html que machaca el anterior:

                                       Ejemplo.html

Mi pregunta es si puedo hacer algo del tipo que me permita, dentro del codigo r incrustado en el markdown, ir cambiando el parametro i como si fuera un bucle, de modo que no lo tenga que hacer manualmente y que ademas para cada caso me genere un html distinto, es decir algo del tipo:

                                      Ejemplo1.html                                      Ejemplo2.html

Un saludo y muchas gracias

        [[alternative HTML version deleted]]

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https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

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Saludos,

Carlos Ortega

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        [[alternative HTML version deleted]]

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