[R-es] redes pathfinder

Vie Ene 4 02:17:27 CET 2013

Hola a todos
Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy
acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero
si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría
en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ...
Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala
RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es
porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica).
Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de
distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis
de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus
lunas, soles, constelaciónes, etc. 
Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de
Benajmin y hay una gran pista para mi idea original.
R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando
pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene
todo lo requerido.  

Javier Marcuzzi

El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió:
> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph.
> 
> El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las  convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame.
> 
> Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html
> 
> Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin.
> 
> Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos!
> Pedro
> 
> El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi:
> 
> Message: 1
> Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100
> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es>
> To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>
> Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org>
> Subject: Re: [R-es] redes pathfinder
> Message-ID:
>         <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain
> 
> Hola,
> 
> Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con
> redes permiten obtener tu caso?.
> 
> Feliz Ao!
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es>
> 
> 
> El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual
> <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi:
> 
> 
> 
> > Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera
> > saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de
> > proximidades sacar la matriz de la red pathfinder.
> >
> > Un cordial saludo y un mejor ao 2013.
> >
> > Juan
> >
> > --
> > ==============================**===========================
> > Juan Antonio Gil Pascual
> > Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva
> > correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es>
> > web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil>
> >
> > U.N.E.D.
> > Fac. de Educacin
> > Dpto. MIDE I
> > c/Juan del Rosal,14 desp. 272
> > 28040 MADRID
> > Tel. 91 398 72 79
> > Fax. 91 398 72 88
> >
> 
> 
> --
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