[R-es] Resumen de R-help-es, Vol 48, Envío 13

Mie Feb 13 22:24:49 CET 2013

Hola Angela, yo tambien he usado la funcion "rarecurve" para crear curvas de rarefacción 
Saludos

Gabriel Antonio Trujillo Paucar
Egresado de Biologia - Especialidad de Ecología
Investigador en el Area de Limnología de CORBIDI
997603768
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> From: r-help-es-request en r-project.org
> Subject: Resumen de R-help-es, Vol 48, Envío 13
> To: r-help-es en r-project.org
> Date: Wed, 13 Feb 2013 12:00:06 +0100
>
> Envíe los mensajes para la lista R-help-es a
> r-help-es en r-project.org
>
> Para subscribirse o anular su subscripción a través de la WEB
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
> O por correo electrónico, enviando un mensaje con el texto "help" en
> el asunto (subject) o en el cuerpo a:
> r-help-es-request en r-project.org
>
> Puede contactar con el responsable de la lista escribiendo a:
> r-help-es-owner en r-project.org
>
> Si responde a algún contenido de este mensaje, por favor, edite la
> linea del asunto (subject) para que el texto sea mas especifico que:
> "Re: Contents of R-help-es digest...". Además, por favor, incluya en
> la respuesta sólo aquellas partes del mensaje a las que está
> respondiendo.
>
>
> Asuntos del día:
>
> 1. Re: Alguien ha usado R para calcular curvas de rarefacción de
> especies en análisis de diversidad? (Fernando Canovas Garcia)
> 2. off topic ¿comparaciones múltiples? (jaume)
> 3. Re: off topic ¿comparaciones múltiples? (Carlos Ortega)
> 4. Re: off topic ¿comparaciones múltiples? (Jorge I Velez)
>
>
> ----------------------------------------------------------------------
>
> Message: 1
> Date: Tue, 12 Feb 2013 19:27:13 +0100
> From: Fernando Canovas Garcia <fcanovas en um.es>
> To: R-help-es <r-help-es en r-project.org>
> Subject: Re: [R-es] Alguien ha usado R para calcular curvas de
> rarefacción de especies en análisis de diversidad?
> Message-ID: <20130212192713.19127346ia5jw22p en webmail.atica.um.es>
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; DelSp="Yes";
> format="flowed"
>
> Hola Ángela,
>
> yo lo he utilizado varias veces. Qué te apetece comentar?
>
> Un saludo
>
> Fernando
>
> On Mon, 2013-02-11 at 12:16 -0600, Angela Andrea Camargo Sanabria wrote:
> Quisiera intercambiar ideas con aquellos que lo hayan utilizado.
> >
[[elided Hotmail spam]]
> >
> > ----
> > *Angela Andrea Camargo Sanabria*
> > Estudiante Doctorado en Ciencias Biolgicas
> > Laboratorio de Ecologa de poblaciones y comunidades tropicales
> > Centro de Investigaciones en Ecosistemas (CIEco)
> > UNAM, campus Morelia
> > Antigua Carretera a Ptzcuaro # 8701
> > Col. Ex-Hacienda de San Jos de la Huerta, CP 58190
> > Morelia, Michoacn, Mxico
> > Tel.: 443-3222706 ext. 42511
> > e-mail: aacamargo en cieco.unam.mx
> > skype: angela.camargo26
> >
> > [[alternative HTML version deleted]]
> >
> > _______________________________________________
> > R-help-es mailing list
> > R-help-es en r-project.org
> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >
>
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 2
> Date: Wed, 13 Feb 2013 10:40:30 +0100
> From: jaume <jautorbla en gmail.com>
> To: "r-help-es en r-project.org" <r-help-es en r-project.org>
> Subject: [R-es] off topic ¿comparaciones múltiples?
> Message-ID: <511B5F8E.5050806 en gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; format=flowed
>
> Estimados herreros,
>
> Sabéis si hay algún sitio donde pueda hacer una pregunta sobre
> estadística, en concreto un diseño experimental. Alguna lista, foros, etc.
>
> Ya se que este no es el sitio adecuado para preguntas de estadística,
> pero por si alguien se pica os la pongo a continuación.
>
> Dos tratamientos C y H.
> Se aplican a una serie de especies (p.e. 10)
> Se observa la respuesta de las especies a cada tratamiento. Para cada
> especie tendremos varios valores (20) para C y varios valores (20) para H.
> Hacemos un modelo lineal en el que se prueba el efecto del tratamiento
> teniendo en cuenta las especies como un factor aleatorio: NO me interesa
> comparar entre especies, solo avisar al modelo que debido a que son
> especies diferentes habrán diferencias.
>
> Después, independientemente del test anterior, hacemos para cada especie
> el test para evaluar el efecto del tratamiento.
> p.e. Para la especie 1 comparamos los 20 valores de C con los 20 valores
> de H y vemos si hay un efecto significativo de el tratamiento. Esto se
> hace con cada especie.
>
> La pregunta es la siguiente:
> Si hubiéramos comparado especie a especie con un test post-hoc para ver
> diferencias significativas ENTRE las especies habríamos aplicado una
> corrección p.e. Bonferroni para la significación. Ahora, nos encontramos
> que hacemos 10 tests, uno por especie ¿Habría que corregir el valor
> critico de la significación de alguna forma? En mi opinión no, son tests
> independientes, uno para cada especie ¿Sabéis donde puedo encontrar
> información sobre esto? Tengo que justificarlo bastante bien, por que
> cualquier referee que vea una tabla con un montón de p-valores querrá
> una corrección de la significación.
>
> Muchas gracias.
>
> Jaume.
>
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 3
> Date: Wed, 13 Feb 2013 10:53:46 +0100
> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
> To: jaume <jautorbla en gmail.com>
> Cc: "r-help-es en r-project.org" <r-help-es en r-project.org>
> Subject: Re: [R-es] off topic ¿comparaciones múltiples?
> Message-ID:
> <CAOKbq8iu7Fqzzzyk5h8aA0NLPZ+pvGOLRtS3hq6Xz-xYwOLD0Q en mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain
>
> Hola,
>
> Tienes un par de sitios de referencia:
>
>
> - Talk Stats: http://www.talkstats.com/index.php
> - Stats Exchange: http://stats.stackexchange.com/
>
> Ambos sitios requiren que te des de alta.
>
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
>
>
>
> El 13 de febrero de 2013 10:40, jaume <jautorbla en gmail.com> escribió:
>
> > Estimados herreros,
> >
> > Sabéis si hay algún sitio donde pueda hacer una pregunta sobre
> > estadística, en concreto un diseño experimental. Alguna lista, foros, etc.
> >
> > Ya se que este no es el sitio adecuado para preguntas de estadística, pero
> > por si alguien se pica os la pongo a continuación.
> >
> > Dos tratamientos C y H.
> > Se aplican a una serie de especies (p.e. 10)
> > Se observa la respuesta de las especies a cada tratamiento. Para cada
> > especie tendremos varios valores (20) para C y varios valores (20) para H.
> > Hacemos un modelo lineal en el que se prueba el efecto del tratamiento
> > teniendo en cuenta las especies como un factor aleatorio: NO me interesa
> > comparar entre especies, solo avisar al modelo que debido a que son
> > especies diferentes habrán diferencias.
> >
> > Después, independientemente del test anterior, hacemos para cada especie
> > el test para evaluar el efecto del tratamiento.
> > p.e. Para la especie 1 comparamos los 20 valores de C con los 20 valores
> > de H y vemos si hay un efecto significativo de el tratamiento. Esto se hace
> > con cada especie.
> >
> > La pregunta es la siguiente:
> > Si hubiéramos comparado especie a especie con un test post-hoc para ver
> > diferencias significativas ENTRE las especies habríamos aplicado una
> > corrección p.e. Bonferroni para la significación. Ahora, nos encontramos
> > que hacemos 10 tests, uno por especie ¿Habría que corregir el valor critico
> > de la significación de alguna forma? En mi opinión no, son tests
> > independientes, uno para cada especie ¿Sabéis donde puedo encontrar
> > información sobre esto? Tengo que justificarlo bastante bien, por que
> > cualquier referee que vea una tabla con un montón de p-valores querrá una
> > corrección de la significación.
> >
> > Muchas gracias.
> >
> > Jaume.
> >
> > ______________________________**_________________
> > R-help-es mailing list
> > R-help-es en r-project.org
> > https://stat.ethz.ch/mailman/**listinfo/r-help-es<https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es>
> >
>
>
>
> --
> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
>
>
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>
> Message: 4
> Date: Wed, 13 Feb 2013 21:07:19 +1100
> From: Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com>
> To: jaume <jautorbla en gmail.com>
> Cc: "r-help-es en r-project.org" <r-help-es en r-project.org>
> Subject: Re: [R-es] off topic ¿comparaciones múltiples?
> Message-ID:
> <CAKL8G3Hfs3-kC04wpw2hXirrpWyJtVG-xdUiU4YDOmLceuTp7A en mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain
>
> Buenas noches Jaume,
>
> Podrias consultar
> http://www.amazon.com/Multiple-Comparisons-Using-Frank-Bretz/dp/1584885742
> Los autores tienen una libreria en R, pero desafortunadamente no
> recuerdo
> el nombre.
>
> Saludos,
> Jorge.-
>
>
> 2013/2/13 jaume <>
>
> > Estimados herreros,
> >
> > Sabéis si hay algún sitio donde pueda hacer una pregunta sobre
> > estadística, en concreto un diseño experimental. Alguna lista, foros, etc.
> >
> > Ya se que este no es el sitio adecuado para preguntas de estadística, pero
> > por si alguien se pica os la pongo a continuación.
> >
> > Dos tratamientos C y H.
> > Se aplican a una serie de especies (p.e. 10)
> > Se observa la respuesta de las especies a cada tratamiento. Para cada
> > especie tendremos varios valores (20) para C y varios valores (20) para H.
> > Hacemos un modelo lineal en el que se prueba el efecto del tratamiento
> > teniendo en cuenta las especies como un factor aleatorio: NO me interesa
> > comparar entre especies, solo avisar al modelo que debido a que son
> > especies diferentes habrán diferencias.
> >
> > Después, independientemente del test anterior, hacemos para cada especie
> > el test para evaluar el efecto del tratamiento.
> > p.e. Para la especie 1 comparamos los 20 valores de C con los 20 valores
> > de H y vemos si hay un efecto significativo de el tratamiento. Esto se hace
> > con cada especie.
> >
> > La pregunta es la siguiente:
> > Si hubiéramos comparado especie a especie con un test post-hoc para ver
> > diferencias significativas ENTRE las especies habríamos aplicado una
> > corrección p.e. Bonferroni para la significación. Ahora, nos encontramos
> > que hacemos 10 tests, uno por especie ¿Habría que corregir el valor critico
> > de la significación de alguna forma? En mi opinión no, son tests
> > independientes, uno para cada especie ¿Sabéis donde puedo encontrar
> > información sobre esto? Tengo que justificarlo bastante bien, por que
> > cualquier referee que vea una tabla con un montón de p-valores querrá una
> > corrección de la significación.
> >
> > Muchas gracias.
> >
> > Jaume.
> >
> > ______________________________**_________________
> > R-help-es mailing list
> > R-help-es en r-project.org
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> Fin de Resumen de R-help-es, Vol 48, Envío 13
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