[R-es] Bases de datos R/Bioconductor

J. Miguel Marin jmmarin en est-econ.uc3m.es
Jue Sep 30 19:44:49 CEST 2010


Hola,

me gustaría encontrar alguna base de datos (de tipo estándar) en 
R/Bioconductor que tenga secuencias de proteinas para probar métodos de 
cluster.

He visto bases de datos (como en EBI o en BRENDA) con secuencias pero 
en formatos fasta o más raros y, en realidad, sólo necesitaría datos 
"test" para ilustrar un método de clasificación. El problema es que no 
estoy muy al tanto de cuáles pueden ser unos datos "test" para 
clasificación de proteínas y si están en forma de algún paquete de 
R/Bioconductor. El caso es que preferiría evitar bajar secuencias a 
ciegas y perderme con los formatos...

Y un saludo a tod en s

jm~

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        J. Miguel Marin

http://www.est.uc3m.es/jmmarin

    Dep. of Statistics
University Carlos III of Madrid
        Spain (E.U.)



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